V NPK mohou testovat vzorky na přítomnost nového typu koronaviru dvě laboratoře. Zpracování vzorku a získání výsledku však není otázkou několika málo minut. Poté, co si laboratoř vzorky přebere, trvá několik hodin, než určí, zda je daný odebraný vzorek pozitivní nebo negativní. „Nejprve vzorky musíme označit datem a hodinou, každému z nich přidělit číslo a zaevidovat jej do počítače,“ popisuje začátek procesu vyšetřování vzorků na koronavirus Hana Hamplová z Oddělení klinické mikrobiologie Pardubické nemocnice a dodává, že než putují do další fáze vyšetření, čekají odebrané vzorky v chladu: „Virus je citlivý na teplo, proto musíme vzorky uchovávat v lednici.“
Až čtyři a půl hodiny
Prvním krokem analýzy vzorku je izolace RNA, tedy ribonukleové kyseliny, která je zjednodušeně řečeno nositelkou genetické informace viru. Proces izolace trvá zhruba hodinu a půl a doposud ji laboranti v laboratořích dělali manuálně, což je vzhledem k počtu vzorků fyzicky poměrně náročné. Nové přístroje však tuto fázi procesu zautomatizují. Potom, co je RNA kyselina odizolována, začíná další fáze procesu vyšetřování.
„Samostatnou RNA kyselinu, kterou jsme získali izolací, pak přeneseme do další části laboratoře, kde se dělá tzv. PCR reakce, tedy polymerázová řetězová reakce. Při té se namnoží určitý úsek této kyseliny do takového množství, abychom z něj byli schopní určit, zda se jedná o daný koronavirus,“ říká Hana Hamplová s tím, že tato reakce trvá zhruba dvě hodiny. „Podle křivky, kterou dostaneme z dané reakce, posoudíme, zda je vzorek pozitivní nebo negativní, to zabere dalších 15 až 20 minut.“ Celý proces vyšetření zabere zhruba 4 až 4,5 hodiny. „Může se stát, že některé výsledky nejsou validní, a proto musíme testování opakovat,“ dodává Hana Hamplová.
Do nynějška tak byla jedna laboratoř schopná vyšetřit kolem 160 vzorků denně. Nové izolátory pomohou Nyní se však kapacita laboratoří Nemocnice Pardubického kraje zvýší díky nově pořizovaným přístrojům – izolátorům, které budou ribonukleovou kyselinu izolovat automaticky a zvládnou pojmout až 48 vzorků najednou.
Pořízením tří nových izolátorů se kapacita laboratoří zvýší až trojnásobně. První přístroj, který se objednával v Jižní Koreji, již včera dorazil do laboratoře Pardubické nemocnice. Dva další izolátory objednané pro Litomyšlskou nemocnici jsou na cestě. Stejně jako většina laboratoří v Česku však i ty nemocniční narážejí na nedostatek potřebných pomůcek, jako jsou chemikálie potřebné pro testování nebo diagnostické kity či samotné odběrové sady.